O Edward και ο Alphonse είναι δύο αδέρφια που ασχολούνται με την αλχημεία από μικρή ηλικία.
Οι ζωές τους αλλάζουν μετά από την αποτυχία ενός πειράματος με μακάβριο αποτέλεσμα. Ο Edward αποφασίζει να γίνει National Certified Alchemist και μαζί με τον μικρό του αδελφό ξεκινάει ένα ταξίδι γεμάτο περιπέτεια για να βρει την φιλοσοφική λίθο και τις απαντήσεις στα ερωτήματα που τον βασανίζουν.